黄连的根茎是黄色,会有分枝,具有很多的须根。
黄芩的根茎十分肥厚,属于肉质的,底部伏地、上升,高度可以达到30-120厘米。底部的径为2.5-3毫米左右。
黄连的叶片有些革质,长度约为3-8厘米,宽度约为2-3厘米。顶端十分尖,呈卵状三角形。
黄芩的叶片为叶坚纸质,长度约为1.5~4.5厘米,宽度约为0.5~1.2厘米。它的顶端是比较钝的,底部为圆形,呈披针形至线状披针形。叶片上面为暗绿色,下面的叶色相对来说比较淡。
黄连的花朵为线形活线状披针形,长度约为5-6.5毫米。它的顶端为渐尖锐,中间具有蜜槽。
黄芩的花为紫色、紫红色或是蓝色,长度约为2.3-3厘米左右。其花柱十分细长,先端比较尖锐,微裂。
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